病源

饮用和使用水中的病菌的产生有几种情况。

如果水在很大的热水储存箱或是水管中停留过长时间，这种病菌就更容易出现，而流动的水则不容易造成这些病菌的生成。所以水管和水箱的材料必须符合一定的标准，这样不会有利于病菌生成的养分进入水中。如果水没有循环，在水的出口必须保证至少60°C。

杀菌

杀菌有以下几种方法：

温度杀菌水加热至少到70°C并维持三分钟。

化学杀菌大多用氯，二氧化氯，氯化钠，次氯酸水, 次氯酸钙溶剂杀菌，在使用化学品之前必须先清洗水管。

紫外线杀菌照射紫外线短波，波长254纳米可以使病菌无法活跃，但可能存在于变形虫里。为更有力的除菌可以再附加使用超声波。

薄膜技术现在越来越多的使用薄膜来去除微生物。一般可以利用薄膜的微孔让直径小于0.2微米(micro meter)的颗粒包括细菌，甚至部分病毒过滤掉。

臭氧杀菌在循环水的冷却塔中投放溶解的臭氧水可以有效代替化学药剂。优点是不改变酸碱也不会造成管道腐蚀。